Paul Brenner (John Travolta) est l'un des meilleurs enquêteurs de la CID (Division des Enquêtes Criminelles de l'Armée américaine). Professionnel aguerri, il connaît parfaitement les rouages et l'état d'esprit de ce corps où il a servi quelques années plus tôt. Appelé au Fort MacCallum, en Géorgie, pour mettre fin à un trafic d'armes, Brenner y fait brièvement la connaissance du capitaine Elisabeth Campbell (Leslie Stefanson), séduisante instructrice des "Opérations Psychologiques", avec laquelle il engage un flirt sans conséquence. Quelques heures plus tard, il apprend que la jeune femme a été violée et assassinée dans l'enceinte du fort. Il découvre par la même occasion qu'Elisabeth était la fille du général Campbell (James Cromwell), héros national en qui les médias voient déjà le futur vice-président des Etats-Unis. Assisté par son ex-compagne Sarah Sunhill (Madeleine Stowe), Brenner se heurte dès le début de ses instigations à une véritable conspiration du silence. Un premier suspect, le colonel Moore (James Woods), mentor et amant probable d'Elisabeth, focalise l'attention des deux enquêteurs, mais son suicide, aussi brutal qu'inexpliqué, interdit toute conclusion. Prenant des détours complexes et psychologiquement tortueux, l'enquête de Brenner et Sunhill les emmène bientôt vers une bien étrange découverte...