A la veille de la reddition du Japon, en 1945, dans un climat de guerre, le docteur Akagi (Akira Emoto), médecin de quartier d'une petite ville du bord de mer, se débat pour sauver l'idée qu'il se fait de sa profession. Lui et ses amis de toujours, un bonze débauché (Jyuro Kara) et un médecin morphinomane et nihiliste (Masanori Sera), sont en marge du Japon démilitarisé. Sauvage, naïve, simple, éventuellement prostituée, une femme, Sonoko (Kumiko Aso) rayonne sur ce trio et découvre sa vocation : aider et aimer ce médecin hors du commun. L'apparition de Piet (Jacques Gamblin), un soldat hollandais blessé, échappé d'un camp de prisonniers, va souder ce petit groupe qui se prend de passion pour un microscope susceptible de découvrir le virus de l'hépatite - cause principale de décès dans un pays mal nourri - et cheval de bataille du docteur Akagi...