Vingt ans se sont écoulés depuis la grande guerre des tomates, lesquelles avaient tenté de détruire l'humanité. Mais le diabolique professeur Gangreen veut s'emparer du pouvoir grâce à une nouvelle armée de tomates tueuses. En effet, ces légumes sont capables de revêtir n'importe quelle forme humaine. La planète Terre est une nouvelle fois menacée menacée par une armée de tomates tueuses, dirigée par un professeur aux desseins diaboliques...