En l'an 2654, le quartier général de Confédération terrienne est entièrement détruit par les redoutables créatures mi-hommes mi-félins de l'Empire Kilrathi. Au cours de cette attaque surprise, les ennemis s'emparent du système central de navigation dévoilant les positions de défenses terriennes et les voies d'accès directes jusqu'à la Terre. Désormais, plus rien ne s'oppose à leur inévitable progression. Stationné à des années-lumière du drame, le vaisseau de combat Concordia, commandé par l'amiral Tolwyn (David Warner), est trop éloigné pour intercepter les Kilrathis avant qu'ils n'atteignent leur cible. Tolwyn alerte alors le lieutenant Christopher Blair (Freddie Prinze, Jr.) à bord du navire marchand Diligent, piloté par Paladin (Tchéky Karyo), un aventurier, seul capable de défier l'attraction magnétique d'un trou noir pour emprunter un raccourci de plusieurs mois dans l'espace-temps. Blair, son inséparable ami Todd Marshall, alias Maniac (Matthew Lillard) et Paladin rallient le vaisseau du capitaine Sasky (David Suchet), le Tiger Claw, afin de diriger les manœuvres contre les Kilrathis. Mais les nouveaux arrivants ne font pas l'unanimité, et Blair aura fort à faire pour s'imposer et faire la conquête de sa séduisante "wing commander" Deveraux (Saffron Burrows).